Especialista de Processos

Produção de Bioetanol

Gabriela Felix Persinoti


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gabriela.persinoti@bioetanol.org.br
Telefone: +55 (19) 3517-5165
Sala: 235 A

Currículo Lattes | Researcher ID | LinkedIn

Biografia

Graduada em Informática Biomédica pela Universidade de São Paulo (2006), Mestre em Genética pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (2009) e doutora em Genética pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (2012). Realizei pós-doutorado na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo com um período de estágio de pesquisa no exterior desenvolvido no Broad Institute – MIT/ Harvard (2014). Atuei em pesquisas nas áreas de Inteligência Artificial e Genômica Funcional, desenvolvendo projetos sobre a resposta adaptativa de fungos filamentosos a condições de estresse, analisando principalmente dados de transcriptoma provenientes tanto de análises de microarrays quanto de RNA-seq. Atualmente, sou bioinformata no Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), sendo que meu trabalho está focado em análises ômicas como genômica, transcriptômica, metagenômica e metatranscriptômica visando prospectar micro-organismos e enzimas com potencial biotecnológico para a produção de etanol de segunda geração a partir de biomassa celulósica.

Formação Acadêmica

2009 – 2012

Doutorado em Genética.
Universidade de São Paulo (USP) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto – Ribeirão Preto-SP, Brasil.


2007 – 2009

Mestrado em Genética.
Universidade de São Paulo (USP) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto – Ribeirão Preto-SP, Brasil.


2003 – 2007

Graduação em Informática Biomédica.
Universidade de São Paulo (USP) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto – Ribeirão Preto-SP, Brasil.

Áreas de Pesquisa

Bioinformática focando em estudos de Genômica, Metagenômica, Transcriptômica e Metatranscriptomica.

A Bioinformática é uma ciência multidisciplinar que combina conhecimento de diversas áreas como computação e matemática para analisar e gerenciar informações biológicas.

Publicações Selecionadas e Patentes

Publicações Selecionadas

  • dos Santos Castro, L., de Paula, R. G., Antoniêto, A. C. C., Persinoti, G. F., Silva-Rocha, R., & Silva, R. N. (2016). Understanding the Role of the Master Regulator XYR1 in Trichoderma reesei by Global Transcriptional Analysis. Frontiers in Microbiology, 7. doi:10.3389/fmicb.2016.00175
  • Mello-de-Sousa, T. M., Rassinger, A., Pucher, M. E., dos Santos Castro, L., Persinoti, G. F., Silva-Rocha, R., … Mach-Aigner, A. R. (2015). The impact of chromatin remodelling on cellulase expression in Trichoderma reesei. BMC Genomics, 16(1), 588. doi:10.1186/s12864-015-1807-7
  • Antonieto, A. C. C., Graciano De Paula, R., Dos Santos Castro, L., Silva-Rocha, R., Persinoti, G. F., & Silva, R. N. (2015). Trichoderma reesei CRE1-mediated Carbon Catabolite Repression in Response to Sophorose through RNA Sequencing Analysis. Current Genomics, 15. doi:10.2174/138920291766615111621290
  • Steindorf, A. S., Persinoti, G. F., Monteiro, V. N., & Silva, R.N . (2015). Fungal metabolic diversity. In: Vijai Kumar Gupta (Editor), Robert L. Mach (Editor), S. Sreenivasaprasad (Editor). (Org.). Fungal Biomolecules: Sources, Applications and Recent Developments. 1 ed. Londres: Wiley, v. 1, p. 239-266.
  • Persinoti, G. F., Peres, N. T. A, Jacob, T. R., Rossi,  A, Vencio, R. Z., & Martinez-Rossi, N. M. (2014). RNA-sequencing analysis of Trichophyton rubrum transcriptome in response to sublethal doses of acriflavine. BMC Genomics, 15(Suppl 7), S1. doi:10.1186/1471-2164-15-S7-S1
  • Dos Santos Castro, L., Pedersoli, W. R., Antoniêto, A. C. C., Steindorff, A. S., Silva-Rocha, R., Martinez-Rossi, N. M., Persinoti, G. F., & Silva, R. N. (2014). Comparative metabolism of cellulose, sophorose and glucose in Trichoderma reesei using high-throughput genomic and proteomic analyses. Biotechnology for Biofuels, 7(1), 41. doi:10.1186/1754-6834-7-41
  • Silva-Rocha, R., Castro, L. D. S., Antoniêto, A. C. C., Guazzaroni, M. E., Persinoti, G. F., & Silva, R. N. (2014). Deciphering the cis-regulatory elements for XYR1 and CRE1 regulators in Trichoderma reesei. PloS One, 9(6), e99366. doi:10.1371/journal.pone.0099366
  • Antoniêto, A. C. C., dos Santos Castro, L., Silva-Rocha, R., Persinoti, G. F., & Silva, R. N. (2014). Defining the genome-wide role of CRE1 during carbon catabolite repression in Trichoderma reesei using RNA-Seq analysis. Fungal Genetics and Biology : FG & B, 73, 93–103. doi:10.1016/j.fgb.2014.10.009
  • Castro, L. D. S., Antoniêto, A. C. C., Pedersoli, W. R., Silva-Rocha, R., Persinoti, G. F., & Silva, R. N. (2014). Expression pattern of cellulolytic and xylanolytic genes regulated by transcriptional factors XYR1 and CRE1 are affected by carbon source in Trichoderma reesei. Gene Expression Patterns : GEP, 14(2), 88–95. doi:10.1016/j.gep.2014.01.003
  • Gras, D. E., Persinoti, G. F., Peres, N. T. a, Martinez-Rossi, N. M., Tahira, A. C., Reis, E. M., … Rossi, A. (2013). Transcriptional profiling of Neurospora crassa Δmak-2 reveals that mitogen-activated protein kinase MAK-2 participates in the phosphate signaling pathway. Fungal Genetics and Biology : FG & B. doi:10.1016/j.fgb.2013.05.007